性格内向只知道一门心思读书的大学生金木研（洼田正孝饰），与偶然邂逅的美丽女孩神代利世（苍井优饰）兴趣相投。谁知一段时间交往过后，利世竟露出可怕的面容，意图生吃掉金木。原来利世是一种名叫“喰种”的变异人

故事发生在1999年，那个不详的世纪之末。坐落在深山之中，由于不断的发生灵异事件而被称为“超自然学院”的私立学校里，迎来了它年轻强势的新一任校长——神代玛雅（日笠阳子配音）。绝对不相信有超自然力量存在