《百妖谱》第四季动画故事讲述，桃天带着小和尚磨牙、小狐妖滚滚和桃都老邻居柳公子一起继续为了寻找失踪的百妖谱而云游四方，在途中遇到暗刀、百知、风果、孰湖、枫生、趸鱼六个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症的故事

魔界之王牛魔王（郭富城饰）与玉帝（周润发饰）为首的神界展开战斗，神界被毁，女娲（张梓琳饰）化身晶石修补天庭，遗落下的一小颗晶石落到人间成了一只石猴，而牛魔王则战败被迫带着妻子铁扇公主（陈乔恩饰）躲到了

天圣国战神将军顾云帆率军击败北戎的入侵后，受重伤奄奄一息。皇帝想为顾家续香火下令赐婚，为救恩人性命，小狐妖夏九儿设法嫁进顾家。两人先婚后爱，经过重重波折，互相袒露真心深情表白，最终冲破人妖界限，定下白

桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。